Covid-19测试和良好的微生物实践和程序
根据美国疾病控制与预防中心(CDC)的说法,COVID-19有两种检测方法:病毒检测和抗体检测。病毒或分子检测确定患者是否积极感染了SARS-CoV-2,通过鼻咽拭子采集样本。另一方面,抗体或血清学检查也被称为过去感染检查,通过血液样本来检测患者是否接触过病毒。针对COVID-19推出的大多数测试都是基于逆转录的病毒测试。由于SARS-CoV-2的遗传物质易碎且短暂,最好立即将采集的样本置于无菌运输管中,或置于冰和特殊介质中,以防止其降解。
图1所示。病毒检测(核酸检测)诊断活性SARS-COV-2感染来源:美国微生物学会
相反,抗体试验靶向感染的人检测抗体对病毒的免疫应答,而不是检测病毒遗传物质。虽然该测试可以在一个小时内给出结果,但大多数专业人员声称这种类型的测试与病毒测试不如视而准确。问题是抗体仅在感染后几周发展,这意味着不建议抗体的测试进行早期诊断,并且可能错过无症状的病例。
图2.抗体试验(血清学)检测SARS-COV-2暴露的免疫应答来源:美国微生物学会
下面概述的是CDC Covid-19协议的病毒检测组件“疾病控制和预防中心(CDC)2019-新的冠状病毒(2019-NCOV)实时逆转录酶(RT)-PCR诊断面板:
试剂和用品(耗材)
测试实验室需要依赖于CDC提供的病毒测试套件的元素的以下用品来运行Covid-19测试。为了保证完全合规性,确保不存在缺失的组件。
- rrt - pcr引物或探针集
- 正模板控制
- RT-QPCR主混音
- 分子级水,无核酸酶
- 一次性无粉手套
- P2 / P10,P200和P1000气溶胶屏障提示
- 无菌,无核酸酶1.5ml微离心机管
- 0.2 mL PCR反应管条或96孔实时PCR反应板和光学8帽条
- 实验室标记笔
- 1.5微离心管和96孔0.2mL PCR反应管的冷却器架
- 1.5毫升微离心管的机架
- 表面去污剂
设备
除了消耗品,实验室还必须创造有利于监测和执行病毒检验的环境。实验室常规进行聚合酶链反应可能符合环境条件。如果没有,以下设备对于冠状病毒测试中的成功输入至关重要。
- 旋涡混合器
有效地混合小体积的液体。
- 微量移素(2或10μL,200μL和1000μL)
可调节的校准器械与一次性无菌尖端一起使用,以转移少量液体。
- 多通道微量蛋白(5-50μl)
可调节的校准仪器与一次性无菌尖端一起使用,一次传递多个少量液体样品。
- 冷块:2 x 96孔冷块
当添加试剂和样品时,固定样品管并保持冷温度。
- 实时PCR检测系统
将可调节的自动PCR循环与光学检测技术相结合。
除所需消耗品和设备清单外,CDC强调,从疑似COVID-19患者采集的标本中进行病毒分离,应由在BSL-2和BSL-3实验室接受过相关技术和安全程序培训的工作人员进行。否则,临床实验室不应尝试进行病毒分离。世界卫生组织(世卫组织)还补充说,在任何情况下都应遵循关于实验室生物安全的国家准则。与此相应,世卫组织发布了《处理和处理COVID-19相关标本的实验室生物安全指南》,并将以下良好微生物操作规范和程序(GMPP)作为非传播性诊断实验室工作(如测序、NAAT)的核心要求。
最佳实践
- 不要在实验室中储存食物或饮料,或像外套和袋子这样的个人物品。在实验室内也禁止进食,饮酒,吸烟和/或涂抹化妆品。
- 在实验室内时,请勿将牙龈和钢笔放在嘴里的材料。
- 处理任何生物材料后,在离开实验室之前,最好用温暖的水和肥皂彻底洗手。
- 不要在易燃物品附近放置明火或热源,也不要让它无人看管。
- 破损的皮肤或任何伤口应在进入实验室前覆盖。
- 实验室设备和消耗品的供应,包括试剂、个人防护装备和消毒剂,应充分和适当的活动前进入实验室。
- 为了减少溢出,旅行或瀑布的事故和事故的机会,应适当地存储供应(每台存储指令)和安全。
- 应遵循适当的标记所有生物药物,化学品和放射性物质。
- 塑料覆盖物等屏障应用于保护书面文件,特别是那些可能需要从实验室中取出的文件。
- 工作要细心、及时、不仓促。疲劳时避免工作。
- 整理工作过程中不必要的物料,保持工作区域整洁。
- 禁止使用耳机,因为它可以分散人员和停止设备或设施报警的注意力。
- 遮盖或去除任何可能撕裂手套材料、容易被污染或作为感染催化剂的首饰。如果经常佩戴,应考虑清洗和去除眼镜或首饰的污染。
- 避免使用移动电子设备,尤其是当特定实验室工作或程序不需要时。
- 保持移动电子设备在不容易被污染或充当感染催化剂的区域。如果将这种器件接近生物剂,请在离开实验室之前使用物理屏障或净化器件。
技术规程
- 在操作标本时,应使用良好的技术,尽量减少气溶胶的形成,避免吸入生物制剂。
- 避免摄入生物制剂,避免接触皮肤和眼睛。
- 处理标本时,不要忘记始终戴一次性手套。
- 戴手套的手应避免与面部接触。
- 在操作过程中,要保护或屏蔽口、眼、脸等可能溅到的部位。
- 为防止伤害和注射生物剂,请仔细处理所有锐利和针头。
- 尽可能把玻璃器皿换成塑料器皿。
- 使用具有钝的剪刀或圆角的端部,优先于具有尖端的端部。
- 最大限度地减少与使用注射器或针头相关的风险,并使用安瓿开启器来安全地处理安瓿。
- 不要将一次性注射器上的针头重新盖上,夹上或取下。
- 应使用装有密封盖的防穿刺或防穿刺容器来处理任何尖锐的材料,如针、针与注射器结合、刀片和碎玻璃。
防止生物药物的分散
- 使用盖子的防漏容器适当固定,应使用在专用废物容器中处理之前的标本和培养物中使用。
- 考虑用消毒剂浸湿垫/纱布打开管。
- 在工作程序结束时,如果任何材料溢出或污染,用合适的消毒剂净化工作表面。
- 为了有效的完全失活,消毒剂应与处理的病原体有效,并留在接触的感染性废料中足够的时间。
当这些做法得到严格执行并使用正确的实验室设备时,操作或操作生物制剂时人员接触的可能性将被降到最低。
引用:
https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/index.html.
https://www.who.int/docs/defaultsource/coronaviruse/laboratory-biosafety-novel-coronavirus-version-1-1.pdf?sfvrsn=912a9847_2
https://asm.org/articles/2020/april/covid-19-testing-faqs.